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《肿瘤生物样本操作规程》编制说明
来源:     时间 : 2019-05-29

《肿瘤生物样本操作规程》编制说明

一、标准编制背景

生物样本库又称生物银行(Biobank),主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本(包括人体器官组织、全血、血浆、血清、生物体液或经处理过的生物样本(DNA、RNA、蛋白等)以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系统。生物样本库(Biobank)是众多重要科研成果快速产业化、应用到临床,实现“转化医学的重要保证,美国、欧洲以及国际卫生组织都投入了几亿到几百亿美元建立大型生物样本库。生物样本库建设是人类重大疾病(尤其肿瘤)基因组、功能基因组、蛋白质组等基础、临床研究与分子诊断标记物、药物靶点研发、健康研究的最珍贵资源与关键环节,也是众多研究成果快速实现产业化即“转化医学”应用到临床如疾病早期诊断,分子分型与个性化治疗、预后评估等的重要保证,毫无疑问也是我国生物医药产业自主创新体系中至关重要环节与保证。生物样本库是融合生物样本实体、生物分子信息以及样本表型数据的综合资源,对于开展人类疾病预测、诊断、治疗研究具有不可替代的重要作用。转化医学的兴起和发展对生物样本资源的迫切需求与日俱增,对生物样本库的数量和质量也提出了更高的要求,各国也已将其视为发展生物医药领域核心竞争力的重要战略举措之一。人类生物样本是人类疾病临床与基础转化医学研究的重要桥梁,是精准医学研究的不可再生性资源。建立人类生物样本采集和保存的技术规程,确保人类生物样本的规范化采集与保存,是高质量人类生物样本研究的基础和关键环节。

目前,不同的生物样本库在建设过程中没有统一的样本采集、处理和贮存标准,导致各样本库存储的样本质量存在较大差别,生物样本库应具备统一的样本采集、处理和贮存技术和方法,才能建设更实用高效的样本库,从而服务于医学研究。进入二十一世纪以来,随着现代生物技术的快速发展,分子遗传学取得了巨大的发展,国外对于人类遗传资源的保护与开发研究势头强劲,主要呈现两个特点,其一是在标准化前提下遗传资源库的大型化。其二就是各个国家内部研究机构和国家之间对遗传资源库的共同建设和共享。为贯彻落实市委、市政府《关于加快建设具有全球影响力的科技创新中心的意见》,进一步加快改革步伐、健全激励机制、完善政策环境,激发医学创新活力和转化能力,聚焦高发病率、高患病率、高致残率、高死亡率和高疾病负担的恶性肿瘤等重大疾病,由上海市生物医药行业协会发起组织,上海芯超生物科技有限公司、生物芯片上海国家工程研究中心牵头北京协和医院、北京大学人民医院、复旦大学附属中山医院、第二军医大学附属长海医院、第四军医大学附属西京医院、中山大学附属肿瘤医院、复旦大学附属肿瘤医院、北京大学肿瘤医院、国家863分子分型与肿瘤基因组重大项目组、海尔集团公司共同起草本标准,该标准适用于肿瘤生物样本的采处理和保存。

二、本标准制定的意义

《肿瘤生物样本操作规程》规定了肿瘤生物样本采集、处理和保存的相关的术语和操作规程。本标准的编制主要在集中整合国内现有样本库建设规范化操作流程的基础上,针对国内生物样本库建设过程中存在的问题,积极采用部分国际操作流程编制而成。本标准的编制填补了国内空白,处于国际先进、国内领先水平。

三、标准编制依据

1、标准采纳情况

本标准在制定过程中,查阅并研究了大量国内外相关文献或文件,包括法国发布的生物样本库国家标准(NFS96-900)、国际生物和环境样本库协会(ISBER)发布的《2012样本库最佳实践规范》、ISO/IEC 17025:2005、ISO15189:2012等文件,探讨国内外现状的差异,结合中国国情制定本标准。然而国际上也并未有专门针对生物样本库的国际标准发布,因此本标准并未采用国际标准和先进国家标准,且属于国内首次制定。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

ISO 15189         医学实验室质量和能力的专用要求

NIPCGR-DCI-03   中国人类遗传资源特性信息描述规范(中国人类遗传资源平台)

临床操作规范(病理学分册)(中华医学会)

全国临床检验操作规程(第三版) (中华人民共和国卫生部医政司)

 

2、标准编制原则

⑴统一协调国内现有操作规范;

⑵积极采用国际规范;

⑶有利于促进技术进步,提高生物样本质量;

⑷有利于保护生物样本资源,提高资源利用效率;

3、样本编码

⑴手术器官代码:见《人体器官代码表》(附录 A)

⑵样本类型代码:见《生物样本类型代码表》(附录 B)

⑶组织样本取材部位代码

正常组织用“ N”表示;

肿瘤旁组织用“ P”表示;

肿瘤组织用“ T”表示;

 ⅳ淋巴结用“ L”表示。

编码规则

a)组织样本编码

由手术器官代码( A)、器官内流水号( B)、样本类型代

码( C)、取材部位代码( D)、样本管/块/份编号( E)五部分组成。

具体编码格式如下: ABCDE。

b)血液、体液、人体排泄物样本编码

由手术器官代码( A)、器官内流水号( B)、样本类型代码( C)、样本管份编号( D)四部分组成。

具体编码格式如下: ABCD。

c)存放位置编码

常温存储设备(石蜡柜和切片柜)样本存放位置采用三级编码:

样本柜号、样本盒号、样本盒内位置编号。三级编码之间用“-”连接。

冷冻存储设备(液氮罐/柜和超低温冰箱)样本存放位置采用四级编码:设备编号、冻存钢架编号、冻存盒号、冻存盒内位置编号。四级编码之间用“-”连接。

4、生物样本的采集

人类生物样本的方案需伦理委员会审查批准并签署《伦理委员会审查意见书》(附录 C),方可准予立项

 

四、术语的定义

安全性:避免危险及伤害发生而制定的流程、程序或使用的技术。

保存:在样本处理和贮存过程中通过使用化学试剂,改变环境条件或者其他手段来防止或延缓样本生物或物理性能的退化。

标签:任何印在或贴在样本容器或包装上的手写、应刷或图形材料。

标识符/识别信息:可以识别主体的信息(如姓名、社保号码、医疗记录或病理号码等)、对于某些样本,这些信息可能包括分类学上的名称和收集时的编号。

冰晶核:是指样本在冷冻过程中最初形成的冰晶,也被成为“晶种”,这是在控制样本冷冻速率是需要考虑的重要因素。

玻璃化:是指不定型物质在快速降温过程中出现液态和玻璃态两种不同物质状态。

玻璃化温度(Tg):是指液态物质转变为玻璃状态的一个特定的温度,在此温度点,物质的黏稠度大大增加,以至于看起来像是处于固体状态。由于极高的黏稠度,物质分子因活动性大大降低而出现分子重组,同时也就显著减缓了物质原来因各种反应而变性的速度。

不良反应:由于某些不可预见的不良因素或者副作用而导致样本的完整性受损的现象。

采集:是指获取某个样本的过程或技术,也可指已经明确研究目的而经过特别方法获取的一个或多个样本。

材料转让协议:是指机构与机构之间一方向另一方提供生物样本而签订的有关转让样本相关信息的协议,转让同意书的主要内容包括接受方将转让的样本用于自己研究需求,还规定了双方使用样本的权利和责任。

查找:是指在样本周期中需要移动、接收、返还、收集或采集样本的不同步骤。

程序:为取得特定结果而设计的一系列步骤。

处理:在样本采集与分发之间的所有流程,包括准备、测试、入库和贴标签。

处置:样本最终处理。

冻干:在真空条件下将冰库样本中的水分转换成气态从而对样本进行脱水后存储。

杜瓦:一种盛放液化气体的特殊容器。

分发:是指从样本申请单的接受、样本选择、最终核查、倒运输至另一样本库、样本采集中心或实验室的过程。

分析物:是指可以用来测定定量的成分,包括任何一个元素、离子、化合物、反应产物、因子、感染性个体、细胞、细胞器、活性、性能或者是其他待确定因素。

分装:是指将样本分成几份并贮存到单个容器中的过程,分装后的样本即成为独立的样本个体,也可作为名词表示一个样本。

干冰:固态的二氧化碳,固化温度-78.5℃。

干燥:水分流失的过程。

干燥液氮罐运输:用于运输保存在气相液氮中样本的容器。

环境监测系统:是指自动化的中央控制的监控系统,主要是监控环境变化以及在远程访问电子数据库和其安全性方面出现异常时发出警报。

回顾性:对于以前的研究和采样(如疾病)进行再一次的审查。

机构审查委员会(IRB):是由某个机构正式任命的一个以理事会、委员会或小组的形式成立的组织,其宗旨是审核机构中任何需要涉及人的医学研究项目并批准启动该项目,另外也对此项目进行定期审查。

校准:将测量仪器的输出或指示值调整到一定的精确度范围内并与所提供的标准值一致的过程。

捐赠者:是指按照既定的医学标准、程序和个人隐私法规确定后提供作为样本的人或尸体。

冷冻保护剂:添加剂或混合添加剂,能使活细胞、组织、器官和生物体在低温环境下生存,主要类型是依数性冷冻保护剂。这种保护性添加剂能够穿透细胞,防止过度的细胞体积变化和溶质浓度过高对细胞造成损害。渗透性保护剂是一种不穿透细胞的添加剂,它通过渗透作用使细胞脱水,使细胞中能够形成冰晶的水分减少,从而使细胞得到保护。依数性保护剂和渗透性保护剂的混合物经常作为植物、藻类和微生物或哺乳动物细胞的冷冻保护剂。

冷冻干燥:真空条件下将冷冻样本中的冰转换成水蒸气,从而实现脱水存储,也称冻干。

冷链:对温度进行恒定控制的供应链。

流程验证:是指论证某个流程的程序,此流程能够持续产生预期的结果。

匿名:不收集与样本相关的可识别的个人信息,或是收集的相关数据被隐藏而不能检索,这样就无法追踪到样本来源。

批次:同一批处理或制造的试剂、耗材和容器都具有唯一的批次号。

批量:是指在特定范围内具有相同的特征和质量的一批样本。

偏差:偏离了程序或惯例的偶然或必然的事件。

前瞻性:按照现行确定的研究目的而后进行的研究或收集数据方式。

清理:审查样本并对需要清除的样本进行销毁或转移。

取样:从目标事物中选择有代表性的样本。

全能性:是指单个植物体细胞能够通过发育中的细胞分化过程再生为一个完整的植物个体。

人类工程学:一门探索人类的能力和极限的科学,其能促进人类与环境、工具、产品和实践的相互作用。

认同:是指经过深思熟虑而达成一致性认识。

容器:用来放置一个或多个样本的贮存器。

审核:对流程、记录、人员职能、设备、设施和(或)供应商进行文件审核,评估其是否遵守已制定的SOP或政府的法律法规。

生物安全柜:为了给工作人员提供隔离、无微生物危害的工作环境而设计的橱柜。

生物危害:来源于生物并对人类健康构成威胁的有机体或物质。包括能影响人类健康的医疗废物、微生物样品、病毒或毒素。也包括对动物有害的物质。

生物样本资源:是指为某个目的而收集的生物样本。样本资源主管负责管理收集到的样本。

生物样本资源主管:是指负责管理生物样本资源的人。与其他项目利益相关者一起,共同管理生物样本资源,包括管理所有与样本资源相关的文件,确保落实有关如何访问资源的政策以及能够按照规范来执行。

尸检:死后对人体器官和组织进行检查以确定死亡原因或病理状态。

事故:在样本检索、处理、标识、贮存或分发过程中,任何因偏离标准操作流程和相关法律法规而影响到样本后续使用的意外情况。

数据库:是指储存在计算机系统中具有一定结构的记录或数据,允许计算机程序或者个人使用查询功能搜索数据库里包含的相关信息。

脱水:从组织中去除水分。

无菌:无任何活性污染微生物的存在。

无菌状态:无任何活的微生物存在的无污染状态。

消毒剂:一种能减少活性微生物数量的试剂。

形态反应性:是指细胞对刺激产生反应的某种变化或在体外操作时,细胞发生的形态变化,通常也会产生结构上的变化,这包括产生芽、根、胚胎。

样本:在某特定时间从受试者或捐献者采集到的组织、血液等样本。对于某些生物样本,样本可以表示个体的意思。

样本库:接受、贮存、处理及分发样本的实体。样本库包含其地理位置以及与其运营相关的所有活动。

遥测系统:将对象参量的近距离测量值传输至远距离的测量站来实现远距离测量的系统,通常是通过无线电波来实现。

液氮:用来冷冻和贮存样本的冷冻剂。

知情同意书:是指有判断能力的个人在获得并了解相关信息之后,在没有受到任何利诱或恐吓等不当行为影响的前提下,自愿同意参加某个研究而做的决定。

质量:样本或程序与预先设定的规范或标准相一致。

质量保证(QA):是包括规划、实施、记录、评估和改进几个方面的综合性管理方式,该管理方式是为了确保每个操作或元素都能够符合项目要求的类型和质量,与质量管理系统(QMS)是一样的。

质量控制:是采用特定测试方式来监控和验证QA或QMS所要求的是否正确,这些要求包括样本的采集、处理、保存、贮存、样本质量和测试精度以及样本的测试方式,还包括但不局限于:评估检测效率、实验和对照、设备和操作流程准确性和可靠性,另外还有对耗材、试剂、仪器和设备的监控。

终端用户:是指医疗系统工作人员、研究者或实验室的工作人员,他们需要执行某个程序,检测或存档等相关工作。

注释:文件中某特定内容的相关附加信息。

贮存:在特定的条件下保存样本供日后使用。

样本采集者:为生命科学研究而采集、保存生物样本的机构或个人,简称采集者。

正常组织:位于同一器官、病理诊断为正常或一般炎症的组织。

肿瘤旁组织:位于同一器官、病理诊断明确不含肿瘤细胞的炎症或肿瘤前病变组织。

常温保存:将样本保存于10℃-30℃常温。

冷藏保存:将样本保存于普通冷藏设备中,保存温度为4±1℃。

冷冻保存:将样本保存于低温存储设备中。根据低温程度的不同,分为普通低温冷冻保存(-40℃)、超低温冷冻保存(-86℃)、深低温冷冻保存(-135—150℃)。

附录.docx